豬舍內有害氣體是普遍存在的，而這些有害氣體對豬的生長、發育、繁殖等產生嚴重影響，進一步對豬場造成巨大的經濟損失。負壓通風是排氣式通風，通風時豬舍的有害氣體被大量抽出，舍內空氣質量較好，風扇風速固定在1.5米/秒即可。由于豬舍里面的氨氣、一氧化碳等有害氣體被通風機抽出，因此，豬在里面沒有咳嗽、呼吸系統等病癥，人在里面都可以感覺得到很舒服，豬在里面生活也自然舒服。
據了解，氨氣主要來自于糞便的分解。氨易溶于水，在豬舍中氨常被溶解或吸附在潮濕的地面、墻壁和豬黏膜上。氨能刺激黏膜，引起黏膜充血、喉頭水腫、支氣管炎，嚴重時引起肺水腫、肺出血；氨還能引起中樞神經系統麻痹，中毒性肝病等。豬處在低濃度氨的長期作用下，體質變弱，對某些疾病產生敏感，采食量、日增重、生殖能力都下降，這種癥狀稱為“氨的慢性中毒”。若氨濃度較高，對豬引起明顯病理反應和癥狀，稱為“氨中毒”。
一氧化碳對血液、神經系統具有毒害作用。它通過肺泡進入血液循環，與血紅蛋白結合形成相對穩定的碳氧基血紅蛋白，這種血紅蛋白不易解離，不僅減少了血細胞的攜氧功能，還抑制和減緩氧合血紅蛋白的解離與氧的釋放，造成機體急性缺氧，發生血管和神經細胞的機能障礙，出現呼吸、循環和神經系統的病變。碳氧基血紅蛋白的解離要比氧合血紅蛋白慢 3600倍，因此中毒后有持久的毒害作用。當一氧化碳濃度在 0.05%時，經短時間就可引起急性中毒。豬舍內一氧化碳濃度應低于0．0025％。
硫化氫是一種無色、易揮發的惡臭氣體，產生自豬舍地面，且比重較大，故愈接近地面，濃度愈大。硫化氫主要刺激黏膜，引起眼結膜炎、鼻炎、氣管炎，以至肺水腫。經常吸入低濃度硫化氫可出現植物性神經紊亂。游離在血液中的硫化氫，能和氧化型細胞色素氧化酶中的三價鐵結合，使酶失去活性，以致影響細胞的氧化過程，造成組織缺氧。長期處在低濃度硫化氫的環境中，豬體質會變弱，抗病力下降。高濃度的硫化氫可直接抑制呼吸中樞，引起窒息和死亡。當硫化氫濃度達到0．002％，會影響豬的食欲。豬舍內硫化氨濃度不應超過0．001％。
二氧化碳主要來源是舍內豬的呼吸。一頭體重100千克的肥豬，每小時可呼出二氧化碳43升，因此豬舍內二氧化碳含量往往比大氣中高出許多倍。二氧化碳本身無毒性，它的危害主要是造成缺氧，引起慢性毒害。豬長期處在缺氧的環境中會精神萎靡，食欲減退，體質下降，生產力降低，對疾病的抵抗力減弱，特別易于感染結核病等傳染病。
